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Evaluador de genes: en el enfoque EAGLE, un equipo de expertos recopila y evalúa las pruebas que relacionan un determinado gen con el autismo./ Cortesía de Andrew Brookes / Getty Images
POR GRACE HUCKINS
Fuente: Spectrum | 05/05/2021
Fotografía: Cortesía de Andrew Brookes / Getty Images
Un novedoso método para evaluar los genes relacionados con el autismo podría revelar cuáles son los más útiles para su detección.
Los investigadores presentaron ayer los resultados inéditos de forma virtual en la reunión anual de la 2021 International Society for Autism Research.
El método, denominado Evaluación de la Evidencia de Vínculos Genéticos en el Autismo (EAGLE, por sus siglas en inglés), evalúa y puntúa sistemáticamente la evidencia que relaciona los genes con el autismo. Los investigadores lo utilizaron para analizar una lista curada de 53 genes considerados por diversas fuentes como fuertemente asociados al autismo.
Entre los 53 genes evaluados, EAGLE identificó 22 que tenían una conexión "definitiva" con el autismo. De los 42 genes etiquetados como de "alta confianza" en una base de datos genética llamada SFARI Gene, sólo 20 resultaron ser definitivos. (SFARI Gene está financiada por la Fundación Simons, la organización matriz de Spectrum).
Si se acepta ampliamente, EAGLE podría ayudar a los científicos a llegar a un consenso sobre el grado de vinculación de los distintos genes con el autismo, dijo el investigador principal, Jacob Vorstman, profesor asociado de psiquiatría en la Universidad de Toronto (Canadá), en una conferencia de prensa el lunes. Y también podría ayudar a que las pruebas genéticas del autismo sean más uniformes y útiles.
"Esto no es puramente académico", dijo Vorstman. "No es nada trivial porque la información de estas listas [como la SFARI] alimenta directamente los paneles de secuenciación que se utilizan para el autismo".
Tarjetas de puntuación
En términos generales, EAGLE adopta el mismo enfoque que ClinGen, un recurso gestionado por los Institutos Nacionales de Salud de EE.UU. que evalúa la solidez de las pruebas que vinculan los genes con diversas enfermedades y afecciones. En el marco de ClinGen, un equipo de expertos recopila todas las pruebas que apoyan la conexión entre un gen y una enfermedad, puntúa cada una de las pruebas individualmente y luego suma esas puntuaciones para determinar una calificación final.
ClinGen es exhaustivo y transparente, una característica que EAGLE compartirá, afirma el investigador del estudio Christian Schaaf, profesor de genética humana en la Universidad de Heidelberg (Alemania). Por ejemplo, las tarjetas de puntuación en ClinGen revelan exactamente por qué un gen individual recibió su calificación.
"Creo que eso es, en parte, lo bueno de ClinGen, que siempre tienes la versión más actualizada de los [protocolos] en línea y accesible para todo el mundo", dice Schaaf. "Es un proceso bastante transparente, y puedes entender cómo se produce la puntuación".
Pero EAGLE también añade al marco ClinGen la incorporación de datos fenotípicos. Dado que los individuos autistas se identifican de forma diferente en los distintos estudios, el marco EAGLE otorga una puntuación más alta a los casos en los que un experto ha confirmado el diagnóstico y una puntuación más baja a aquellos en los que se menciona el autismo o los rasgos autistas sin ninguna explicación.
EAGLE también penaliza la puntuación de un gen si las mutaciones observadas en personas autistas también aparecen en personas no autistas. Como resultado, EAGLE da puntuaciones bajas a algunos genes que SFARI Gene etiqueta como de alta confianza. Según EAGLE, seis de estos genes sólo tienen pruebas limitadas de su relación con el autismo. Vorstman anunció en la conferencia de prensa del lunes que la Fundación Simons tiene previsto incluir las puntuaciones de EAGLE en la base de datos de SFARI Gene.
"EAGLE es un enfoque más estricto", dice Schaaf. Y este rigor, dice, es parte de lo que hace que EAGLE sea clínicamente útil. "Si un médico informa de un cambio genético a la familia, siente que tiene que ser significativo. Y quizá debería serlo".
Lea más informes de la reunión anual de 2021 de la Sociedad Internacional para la Investigación del Autismo.
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